巴彦淖尔市农牧业资源得天独厚，水土光热组合条件好，地处北纬40度黄金种植带上，有耕地1383.73万亩，是国家重要的粮油生产基地，全国最大的有机原奶、葵花籽、脱水菜生产基地，全国最大的无毛绒分梳基地，全国第二大番茄原料生产和番茄制品加工基地，全国地级市中四季均衡出栏量最大的肉羊养殖加工基地，培育出“巴美肉羊”“华蒙肉羊”等拥有自主知识产权的肉羊品种。
巴彦淖尔市处于全国著名的狼山-渣尔泰山多金属成矿带上，矿产种类多、储量大。全市查明资源储量的矿种有46种，列入《内蒙古自治区矿产资源储量表》的矿种有38种。其中，硫铁矿储量居全区首位，铅锌铜储量在全区也占重要地位。此外，在河套平原及乌拉特中旗巴音杭盖已探明石油储量2.7亿吨，预测远景资源量10.5亿吨。
巴彦淖尔市风光资源富集，全市年平均风速达8米每秒以上，稳定性好，开发价值高；太阳能资源量居全国前列，年日照时数3200小时左右，光照充足、热量丰富，建设大型风电光伏基地条件得天独厚。2024年底新能源装机规模达到980.42万千瓦。
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